Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM44Q96DX7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms