Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAF2Q96CS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms