Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms