Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms