Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC102AQ96A19 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC102AQ96A19 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms