Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms