Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms