Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms