Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATAD2BQ8WXI9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATAD2BQ8WXI9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms