Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms