Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATRIPQ8WXE1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms