Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms