Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms