Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms