Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGMS2Q8NHU3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms