Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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