Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L2Q8NAA4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms