Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CHCHD4Q8N4Q1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD4Q8N4Q1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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