Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC2Q8N158 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms