Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF550Q7Z398 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms