Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BBS12Q6ZW61 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms