Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00173Q6ZV60 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms