Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms