Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC73Q6ZRK6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms