Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD2Q6Y1H2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms