Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms