Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms