Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETMD1Q6P1Q0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms