Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NANOGP8Q6NSW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms