Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SLC9A4Q6AI14 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A4Q6AI14 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms