Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GFI1BQ5VTD9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1BQ5VTD9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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