Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD5Q5TGI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms