Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM74A1Q5RGS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms