Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms