Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC3LQ587J8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms