Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TDRD12Q587J7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms