Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms