Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF8Q3BBV2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF8Q3BBV2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms