Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HFEQ30201 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HFEQ30201 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HFEQ30201 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HFEQ30201 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms