Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RTL8BQ17RB0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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