Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDK4Q16654 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDK4Q16654 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms