Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTF1Q16619 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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