Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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FXNQ16595 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FXNQ16595 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FXNQ16595 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FXNQ16595 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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FXNQ16595 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FXNQ16595 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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