Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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