Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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