Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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