Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F4Q16254 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F4Q16254 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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