Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PUM3Q15397 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
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