Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB35Q15286 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB35Q15286 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB35Q15286 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB35Q15286 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RAB35Q15286 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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