Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
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PTPAQ15257 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPAQ15257 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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